A operação cec compile-template é um aplicativo NodeJS que é executada fora de qualquer browser. Como a página não é renderizada em um browser, não há objeto DOM ou janela e as bibliotecas JavaScript do cliente, como JQuery, VueJS ou KnockoutJS, não funcionarão.
Embora seja possível usar uma biblioteca JSDOM para criar um objeto DOM e executar essas bibliotecas do cliente, há pouca vantagem em fazer isso. Para um parsing de HTML simples, você pode usar um parser NodeJS HTML como o cheerio.
O HTML retornado pela marcação precisa ser válido. Ele será transmitido por um parser e apenas o HTML com parsing será adicionado à página. Isso serve para confirmar que o HTML compilado não tem tags incompatíveis que possam interromper os slots.